毛细管电泳(STR/SSR/AFLP/T-RFLP)基因检测
服务简介
公司依托3730XL 测序仪检测平台专门开发了针对基因长度多态性进行检测项目,包括STR/SSR、AFLP、MLPA 和T-RFLP 检测和实验项目。STR/SSR(Microsatellite,微卫星标记)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列,因此被认为是继限制性片段长度多态性(RFLP)之后的第二代遗传标记,广泛应用于遗传制图、基因定位、法医学鉴定、人类学以及遗传病的诊断等许多领域的研究。AFLP(amplified fragment length polymorphism,扩增片段长度多态性)是由荷兰科学家Pieter Vos 等于1995 年发明的分子标记技术,是基于PCR 技术扩增基因组DNA限制性片段,基因组DNA 先用限制性内切酶切割,然后将双链接头连接到DNA 片段的末端,它结合了RFLP 和PCR 技术高效性特点,用荧光标记的引物进行PCR 扩增,产物进行毛细管电泳检测,可使某一品种出现特定的DNA 谱带,得到某物种DNA 多态性的指纹图谱。MLPA(multiplex ligation-dependent probe amplification,多重连接探针扩增)于2002 年由Schouten 等首先报道,是近几年发展起来的一种针对待检DNA 序列进行定性和半定量分析的新技术,基本原理包括探针和靶序列DNA 进行杂交,之后通过连接、PCR 扩增,产物通过毛细管电泳分离及数据收集,分析软件对收集的数据进行分析得出结论,目前已经应用于多个领域、多种疾病的研究。T-RFLP (Terminal restriction fragment length polymorphism,末端限制性长度多态性)技术是发明于上世纪末用于分析环境微生物多样性的一种新方法,其原理是在RFLP引物的一端加上荧光标记进行PCR、产物经酶切后用3730XL 测序仪检测,检测结果以峰的位置和面积表示微生物的种类和数量,进而反映目标微生物群落的组成及时空动态,目前T-RFLP技术已被广泛用于分析各种环境中某类微生物的群落结构。
主要流程
STR/SSR
T-RFLP
AFLP
MLPA
订购信息
服务名称 | 说明 | 周期 | 报价 |
STR/SSR/T-RFLP/MLPA等直接检测 | 客户直接提供荧光标记PCR产物3730XL测序仪检测 | 3日 | 询价 |
STR/SSR实验服务 | 引物设计、PCR、检测、数据分析等 | 4-6周 | |
T-RFLP实验服务 | 包括引物设计、PCR、酶切、检测、数据分析等 | 3~5周 | |
AFLP实验服务 | 包括订制试剂盒、酶切、PCR、检测、数据分析等 | 3~5周 | |
STR/SSR引物开发 | 至少开发10对有效引物 | 6~8周 |
客户提供
提供样品
血液样品:样品为EDTA 抗凝或枸椽酸钠抗凝,样品量大于0.5 ml,样品采集后于-20°C 或-80°C 保存;
动植物组织样品:样品可以为新鲜组织(最好-80°C 保存),也可以是95%乙醇中固定的组织,组织量大于500 mg;
DNA 样品:纯度OD260/OD280 在1.8-2.0,STR/SSR/T-RFLP,浓度≥ 20 ng/μl,总量>20 μl;AFLP/MLPA 浓度≥ 100 ng/μl,总量>501 μl。
提供信息
基因信息:待测STR/SSR 位点、序列或引物;
AFLP 需要提供所用内切酶名称、接头引物及PCR 标记引物信息;
T-RFLP需要提供检测基因,如16S、18S 或其它基因及引物,内切酶名称等;
MLPA需要提供待基因信息,MLPA探针试剂盒号等。
交付
交付报告
实验报告(实验步骤,材料方法,结果等)、PCR 电泳照片、原始文件、PDF 格式蜂图、Excel 表格数据。