芯片名称

芯片信息

Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

该芯片涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化（CNV，Copy Number Variation）的探针

Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似，既包含SNP探针，也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。

Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

芯片覆盖indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多个水稻亚种的44,1000个SNP。 每10kb至少包括1个SNP，每个SNP设计12个探针技术重复相关系数R2 > 99%。

芯片名称

芯片信息

Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

该芯片包含了47,000个转录本，代表了38,500个明晰的人类基因。数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly。

Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0

较高分辨率的基因芯片，支持所有转录本异构体的全转录组分析，包含超过六百万条不同探针，覆盖编码和非编码转录本。

该芯片为每个外显子设计约10条探针，每个外显子之间的剪接点有4条探针，确保每个实验都能获得完整、准确和可重复的数据。重复性高（批内相关系数≥0.99），所有检测过的组织观察到的变异系数（CV）<6.5%。样品类型既包括新鲜冻存样品，也包括FFPE 样本。

Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array

Affymetrix新一代全转录本芯片，在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA， 与上一代1.0 ST Array相比，2.0 ST Array有更多的优点：全面覆盖转录组，可以同时检测>30,000个编码的转录本和>11,000个长链非编码转录本；探针设计最大程度覆盖所有外显子，可检测选择性拼接/转录本变体。每个转录本覆盖特异探针的数目中值达到21种，每种探针的长度为25bp，这意味着每个转录本将被检测的碱基数中值高达525个；重复性高；灵敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array（

Affymetrix新一代全转录本芯片，在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA， 与上一代1.0 ST Array相比，2.0 ST Array有更多的优点：全面覆盖转录组，可以同时检测35,240个编码的转录本和>2,000个lincRNA；探针设计最大程度覆盖所有外显子；重复性高；灵敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array

该芯片涵盖了39,000个转录本，代表34,000个明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。 

Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array

该芯片包含有31,000个probe sets，代表28,000个明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等权威数据库。 

芯片名称

芯片信息

Affymetrix miRNA 4.0 Arrary

覆盖miRBase v20数据库，同时检测203个物种的miRNA，信息量大-芯片结果包括：host gene ID、miRNA target genes、clustered miRNA等

Affymetrix miRNA 3.0 Arrary

含盖Sanger miRBase V17.0数据库，同时检测153个物种的miRNA，同时检测成熟miRNA和miRNA前体，能检测人snoRNA和scaRNA