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RNA (m6A) 甲基化检测

服务简介

RNA 甲基化是表观遗传学的重要内容之一, 其中m6A甲基化(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是较为常见的一种甲基化修饰,是指腺嘌呤的6号碳原子连接的氨基基团中的一个氢被甲基基团取代,在m6A甲基化过程中涉及到3类重要的酶:①Writers,甲基化酶,催化m6A甲基化的发生;②Erasers,去甲基化酶:去除m6A甲基化的修饰;③Readers,m6A识别蛋白,识别m6A修饰位点。m6A甲基化修饰过程是动态可逆的。已有研究证明m6A甲基化修饰在转录后调控中发挥作用,在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色,这也意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程,如干细胞分化、生物节律等,在包括肿瘤、肥胖和不育等疾病的发生发展中的作用也有报道,因此对RNA m6A甲基化修饰的研究具有重要意义。

技术支持

电话:021-57072091
Email:service2@sangon.com

图1. 6-甲基腺嘌呤化学结构及可逆反应过程

图2. m6A的动态修饰及介导的生物学功能

主要流程

MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)

RNA提取与质检
RNA随机打断
免疫共沉淀(IP)
反转录与建库
NGS测序
数据分析

MeRIP-qPCR

目的基因m6A位点预测
RNA提取与质检
RNA随机打断
免疫共沉淀(IP)
反转录与qPCR
数据分析

总RNA/mRNA m6A定量检测(Dot Blot法)

RNA提取与质检
变性与交联
封闭孵育
一抗孵育
二抗孵育
显色底物孵育
图片定量分析

订购信息

服务项目 服务内容 周期
RNA m6A测序(MeRIP-Seq) RNA/mRNA提取与质检、随机打断、IP、建库、NGS测序、数据处理 4~8周
RNA m6A qPCR检测(MeRIP-qPCR) RNA/mRNA提取与质检、随机打断、IP、qPCR、数据分析 3~5周
RNA/mRNA m6A定量检测(Dot Blot) RNA提取与质检、变性与交联、封闭、抗体孵育、显色、定量分析 2~3周

客户提供

提供样本

Total RNA样本

细胞样本

组织样本

具体样本要求请详见《RNA甲基化(m6A)检测服务订购表》中附件:《送样要求》。

提供信息

物种信息,单基因检测提供目的基因

《RNA(m6A)甲基化检测服务订购表》

最终交付

样品质控结果、原始数据、实验结果图。

标准实验报告(包括实验流程、步骤、实验结果及试剂耗材厂家)。  

部分结果展示

图1. 甲基化峰注释

(利用最新的RefSeq数据库,每个峰通过与其最邻近基因位置关系对甲基化峰进行注释,分成:外显子峰,内含子峰,非翻译区峰,基因间m6A峰。)

图2. m6A信号区可视化

( m6A甲基化测序结果中的wig文件能够上传到基因组浏览器中,以便进行m6A信号区域的可视化。)

图3. MeRIP-qPCR检测各组细胞中ANPG m6A修饰水平差异。

图4. Dot Blot检测各组细胞中总m6A修饰水平,以亚甲基蓝染色作为RNA上样量内参。