RNA (m6A) 甲基化检测
服务简介
RNA 甲基化是表观遗传学的重要内容之一, 其中m6A甲基化(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是较为常见的一种甲基化修饰,是指腺嘌呤的6号碳原子连接的氨基基团中的一个氢被甲基基团取代,在m6A甲基化过程中涉及到3类重要的酶:①Writers,甲基化酶,催化m6A甲基化的发生;②Erasers,去甲基化酶:去除m6A甲基化的修饰;③Readers,m6A识别蛋白,识别m6A修饰位点。m6A甲基化修饰过程是动态可逆的。已有研究证明m6A甲基化修饰在转录后调控中发挥作用,在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色,这也意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程,如干细胞分化、生物节律等,在包括肿瘤、肥胖和不育等疾病的发生发展中的作用也有报道,因此对RNA m6A甲基化修饰的研究具有重要意义。
图1. 6-甲基腺嘌呤化学结构及可逆反应过程
图2. m6A的动态修饰及介导的生物学功能
主要流程
MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)
MeRIP-qPCR
总RNA/mRNA m6A定量检测(Dot Blot法)
订购信息
服务项目 | 服务内容 | 周期 |
RNA m6A测序(MeRIP-Seq) | RNA/mRNA提取与质检、随机打断、IP、建库、NGS测序、数据处理 | 4~8周 |
RNA m6A qPCR检测(MeRIP-qPCR) | RNA/mRNA提取与质检、随机打断、IP、qPCR、数据分析 | 3~5周 |
RNA/mRNA m6A定量检测(Dot Blot) | RNA提取与质检、变性与交联、封闭、抗体孵育、显色、定量分析 | 2~3周 |
客户提供
提供样本
Total RNA样本
细胞样本
组织样本
具体样本要求请详见《RNA甲基化(m6A)检测服务订购表》中附件:《送样要求》。
提供信息
物种信息,单基因检测提供目的基因
《RNA(m6A)甲基化检测服务订购表》最终交付
样品质控结果、原始数据、实验结果图。
标准实验报告(包括实验流程、步骤、实验结果及试剂耗材厂家)。
部分结果展示
图1. 甲基化峰注释
(利用最新的RefSeq数据库,每个峰通过与其最邻近基因位置关系对甲基化峰进行注释,分成:外显子峰,内含子峰,非翻译区峰,基因间m6A峰。)
图2. m6A信号区可视化
( m6A甲基化测序结果中的wig文件能够上传到基因组浏览器中,以便进行m6A信号区域的可视化。)
图3. MeRIP-qPCR检测各组细胞中ANPG m6A修饰水平差异。
图4. Dot Blot检测各组细胞中总m6A修饰水平,以亚甲基蓝染色作为RNA上样量内参。